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¿Por qué se aplica una tarta de manzana a este análisis de CoV? – ciencia

Christoph Bock, del Centro de Medicina Molecular, explicó la semana pasada cómo funciona la secuenciación y por qué lleva tanto tiempo.

El proceso de secuenciación ha recibido un impulso mediático en los últimos días. La desafortunada causa es la mutación del Coronavirus B 1.1.7, que llegó a Austria desde Gran Bretaña. Tal vez el empezó Jochberg, ella Racimor al mismo tiempo también se conoce en otros estados federales. Finalmente, los resultados positivos de las pruebas de los instructores de esquí en St. Johann im Bungau Relacionado con la nueva mutación.

A Conferencia de prensaDirigido por el ministro de Salud Rudolf Anschober con reconocidos expertos, el investigador del genoma Christoph Bock del Centro de Medicina Molecular también tuvo una opinión. Describió un proceso de secuenciación que podría usarse para determinar si una muestra de corona positiva era una con una cepa mutante de SARS-CoV-2. El científico también explica en sus descripciones por qué, como vimos anteriormente, un análisis de este tipo lleva una semana entera.

Diferencias en los procedimientos de prueba

Al comienzo de su presentación, comparó métodos de prueba comunes con una gran pila de recetas en las que encontrar tarta de manzana. El popular caramelo representa al Coronavirus en este ejemplo, y las imágenes se analizarán en una prueba rápida de antígenos. Mira las imágenes y trata de determinar por fuera si es una tarta de manzana. Para la prueba de PCR, recuerde parte de la receta. Sabes, por ejemplo, que necesitas 1 kilogramo de manzanas y pasas para conseguir una tarta de manzana. Si estos ingredientes aparecen en una receta, es claramente una receta de tarta de manzana.

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La secuencia completa del genoma, como se llama el método complejo exacto, recorre toda la receta y, basándose en todos los datos disponibles, decidirá si la receta presente es una plantilla para la tarta de manzana. Como resultado, se excluyen las evaluaciones falsas y también pueden ocurrir con otros procedimientos. Las imágenes pueden ser complicadas o estar mal ilustradas, dijo Bock, y algunas recetas te dan medio kilogramo de manzanas. Estas aberraciones se encuentran durante la secuenciación.

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Es por eso que este procedimiento lleva tanto tiempo.

Los siguientes párrafos explican el dibujo anterior y se basan en las declaraciones de Christoph Bock: Para empezar, por supuesto, hay un ensayo. De este ARN se toma y se reescribe de tal manera que se pueda “hacer bien” con él en el laboratorio (punto 2). En el siguiente paso, se aísla y replica el material genético correspondiente al virus (punto 3). Luego, las muestras vienen en su equipo de secuenciación y dispositivos de alta tecnología. A continuación, la cepa del virus se reconstruye utilizando “cubos de lego de colores” (punto 4). Este proceso implica capturar varias imágenes de alta resolución bajo un microscopio. La secuencia completa de ARN o ADN del virus se puede reconstruir a partir de los componentes básicos que luego se pueden ensamblar.

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Cada uno de estos pasos lleva al menos un día, como se muestra en la figura. La máquina en la que tiene lugar este proceso de remodelación funciona de forma continua durante dos días, las 24 horas del día. Luego, la secuencia sale en muchas piezas pequeñas. Entonces la computadora tiene que recopilar más de 30.000 caracteres. Entonces sabes “desde un punto de vista genético todo lo que hay que saber sobre el virus”, explica Bock. Se pueden reconstruir los árboles genealógicos, se puede ver quién ha golpeado a quién y también se puede decir con certeza si la infame mutación B es 1.1.7. Actuar. La ventaja crucial de este método es que puede mirar hacia el futuro hasta cierto punto y ver cómo se desarrollarán las mutaciones.

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Sin embargo, dado que este procedimiento lleva mucho tiempo, solo debe utilizarse para evaluar desarrollos privados. No es la forma preferida de averiguar cuántos casos de mutación británica hay en Austria, sino de validar lo que está configurado con pruebas de PCR extendidas. También puede intentar averiguar cómo evolucionó el virus. Para el futuro, también está el problema de una resistencia específica contra la cual se pueden acumular varias formas de virus, y posiblemente también contra una vacuna.

Dr. Puedes encontrar a Christoph Bock en el video de 33 minutos y 50 segundos.

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